जेएनयू छात्र संघ के अध्यक्ष कन्हैया को उसी प्रदर्शन की वजह से जेल जाना पड़ा, जिसमें अफजल के समर्थन में नारे लगाए जा रहे थे. तिहाड़ जेल में कन्हैया को उसी जगह रहना पड़ा, जिसमें आतंकी अफजल गुरु कैद था.