व्यापम घोटाले की जांच पर सवाल उठ रहे हैं. विपक्ष रट लगा रही है कि सीएम शिवराज सिंह चौहान को केंद्र को चिट्ठी लिखनी चाहिए और घोटाले की सीबीआई जांच की सिफारिश करनी चाहिए. लेकिन शिवराज का कहना है कि मामला कोर्ट के अंतर्गत है, लिहाजा उनके हाथ बंधे हुए हैं. इन सबके बीच खुद केंद्रीय मंत्री उमा भारती ने भी इस घोटाले की एसटीएफ जांच पर सवाल खड़े किए हैं.