एनआईए की शुरुआती जांच पूरी कर ली गई है. गृह सचिव ने बताया कि एनआईए ने जो शुरुआती जांच की रिपोर्ट सौंपी है, उसके मुताबिक, पुणे के धमाके सुनियोजित हमले लगते हैं. इसके अलावा शक ये भी है कि इस धमाके के पीछे इंडियन मुजाहिद्दीन का हाथ है.