समीर वानखेड़े के धर्म को लेकर बड़ा विवाद हैं. इस विवाद की सबसे बड़ी वजह महाराष्ट्र सरकार के मंत्री नवाब मलिक द्वारा जारी किया गया समीर वानखेड़े का जन्म प्रमाण पत्र और निकाहनामा। दोनों में उनका नाम समीर दाऊद वानखेड़े लिखा हुआ है. मंत्री के आरोप पर वानखेड़े फैमिली की सफाई आई लेकिन अब पूरे मामले पर दो ऐसी गवाही सामने आई हैं जो वानखेड़े के धर्म को लेकर चौंकाने वाले तथ्य बताते हैं. निकाह कराने वाले काजी का दावा भी यही है कि समीर वानखेड़े ने बतौर मुस्लिम निकाहनामे पर दस्तखत किए थे. परिवार का दावा है कि समीर वानखेड़े ने धर्म नहीं बदला. देखें ये रिपोर्ट.