ज्योति मल्होत्रा के पाकिस्तान के लिए जासूसी मामले में उसका सीधा संबंध आईएसआई और पाकिस्तानी उच्चायोग के अधिकारी दानिश से सामने आया है. दानिश के कहने पर ज्योति जासूसी कर रही थी और इसी नेटवर्क में शामिल शहजाद को भी दानिश ने आईएसआई हैंडलर्स से मिलवाया था.