सम्राट चौधरी सरकार मदरसों को लेकर कड़ाई बरत रही है. शिक्षा विभाग ने मदरसों को मिलने वाले अनुदान की जांच के आदेश दिए हैं. इसके तहत सभी जिलों में शिक्षा अधिकारियों को स्पष्ट दिशा निर्देश प्रदान किए गए हैं ताकि अनुदान का सही उपयोग सुनिश्चित हो सके.